在占领广州城后，尚可喜、耿仲明制造了骇人听闻的广州大屠杀，据意大利传教士卫匡国撰写的回忆录中记载，在这场完全是汉人屠汉人的杀戮中，共有二十多万男女老幼，悲惨地死于同族人的刀下。
与此同时，“孤胆汉奸”孔有德也从全州发起攻击，在永历4年（公元1650年）8月，孔有德率部杀向桂林，守卫桂林的就剩下曹志建和焦琏了。
曹志建率军迎敌，连战连败，被斩杀近万人，所部也被逼近徭峒中。
在击溃曹志建之后，孔有德率部继续逼近桂林城。
大敌当前，能担当起桂林守卫重任的也只剩下了开国公赵印选、卫国公胡一青手下的滇军了。
但赵印选、胡一青认为有恩于他们的何腾跤已死，大家没有义务去用鲜血和生命去保卫那个“素无交情”的桂林留守瞿式耜，两人一琢磨，决定率部前往投奔贵州的忠勇军，而被董克治整编为4部兵马
滇军的不战而遁，让瞿式耜直气得捶胸顿足骂道：““朝廷平时以高爵侍你们，百姓以膏血养你们，你们今天却不发一矢就四散而逃，可知头顶三尺有神灵。
在大骂之后，瞿式耜决定以死报国，与张同敞一起取酒同饮，明烛达旦，然后在9月5日被大摇大摆进入桂林城的清军所俘获。
但瞿式耜、张同敞表现出传统士大夫的气节，一心求死的他们见孔有德根本不敢杀他们，最后竟然使出反间计让孔有德将他们自个儿杀死了。
在广州、桂林相继失守之后，南明顿时陷入空前危机，很多投机分子纷纷跳出来，以便分最后一杯羹。
先是永历帝亲信大将，假传圣旨的庆国公陈邦传看到瞿式耜已死，感到有机可趁，决定挟持永历帝并将其当着礼物送给蛮清，已获得高官厚禄。
谁知道走漏了风声，永历帝朱由榔车驾急速离开，见到时机暴露之后，陈邦传迅速的拿宣国公焦链出气，以宴请为名宴请焦链，在宴席上斩杀焦链，并迅速的兼并焦链部众从而成为广西最大的军法。
听到陈邦传竟然如此劫持永历帝，众人以异常眼神看着杨昭，有的更是暗地里怀疑这是杨昭指示所为。
杨昭连连摇头道：“各位，永历帝虽然一心只知道逃跑，但毕竟是抗击鞑子的一面旗子，陈邦传丧心病狂，竟然劫持永历帝，是可忍孰不可忍，到时候若是擒获陈邦传，孤王一定治陈邦传之罪。”
听杨昭如此说，众人方长舒一口气。
对广州失守，兵司侍郎赵荣贵摇头道：“如果我们情报无误，杜永和、李元胤可有十万大军，怎么能够困守孤城让鞑子轻易的攻破广州城呢？
还有，曹志建也有大军2万，赵印选、胡一清也有1万大军，焦链有2万大军，陈邦传有3万大军，孙可望有2万大军，你们在广西可足足有10万大军，怎么能够任由鞑子猖狂如斯？”
王国玺叹息道：“侍郎，南明军队你不是不知道，军队大多是老弱妇孺，真正能堪一战的不足一半，算得上精锐的更少啊，他们怎么像我们忠勇军这样全都是精挑细选的忠勇之士啊。
王爷组建忠勇军，各部将士多为精锐死士，在战场上我们大家都可以身先士卒，但南明那帮老爷兵则不这样啊，还没有交战他们常常跑得老远啊。”
殷承柞摸着那半截胡须道：“王爷，如此观之，大明已亡亦。说说也是，刚从肇庆回到梧州后不思进取，马上进行清洗，将袁彭年、金堡、蒙正发、刘湘客等人全部罢黜。
这次瞿式耜被杀之后，陈邦传马上兼并瞿式耜手下军队，大明如此行径让人寒心啊。
王爷，鞑子三王主力正在围攻两广，王爷应该率领主力东进，占领南京，截断长江，阻断鞑子主力归路啊。”
钱邦芑嚷道：“王爷，断不可如此亦，王爷，如此作为将影响王爷清誉亦。王爷，虽然我等都知道大明已经连亡四次，但王爷一直奉大明为正朔，我等与永历帝有君臣之名亦。
如今孔有德、尚可喜、耿仲明大军压境，皇帝处于困境之中，王爷应该兴义师以援之，如此以全君臣大义，也为天下臣工做出君臣的表率啊。
再说了鞑子在江南集结重兵，若贸然进攻恐陷入敌人围攻之中，如此胜负难料亦。微臣为王爷计之，恳请王爷率部南征，以救皇帝于水火之中啊。”
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